Файл структурных факторов.
Для изучения файла структурных факторов была выбрана пептидогликановая гликозилтрансфераза из Burkholderia ambifaria 5UY7 . Файл структурных факторов был скачан с сайта PDB в формате mmCIF 5uy7-sf.cif . Колонки: h, k, l, status (если есть), F, sigmaF были сохранены в файл Excel pr7.xlsx с добавленной колонкой сила сигнала F/sigma.
Число структурных факторов = 42 618
Процент структурных факторов у которых сила сигнала >= 3 = 91,22%
Число структурных факторов, использованных для оптимизации модели = 40 569
Тройка точно пропущена, если ее нет среди измеренных структурных факторов,но есть измеренный структурный фактор (h',k', l') с h'>=h, k'>=k, l'>=l. Ниже представлен пример таких троек.
h k l
0 2 3
0 2 16
0 10 7
0 0 23
0 0 67
Ссылки:
© Кузнецова Ксения, 2015